IMPACT DE L'ÉPANDAGE DE DÉCHETS URBAINS SUR LES COMMUNAUTÉS DE BACTÉRIES DANS LES SOLS CULTIVÉS DE LA PÉRIPHÉRIE DE OAGADOUGOU, BURKINA FASO

E. Hien, S. Favre-Bonté , S. Nazaret, D. Masse
La présente étude se propose d’évaluer les effets des activités anthropogéniques, par exemple l’épandage de déchets urbains sur les terres agricoles, susceptibles de provoquer l’apparition ou la propagation de pathogènes. Une étude a été menée sur l’impact de l’épandage de déchets urbains non traités sur des communautés de bactéries contenues dans le sol et l’abondance de pathogènes humains opportunistes. Les sols qui ont été amendés par les déchets ont fait l’objet d’un échantillonnage sur trois sites de la périphérie d’Ougadougou; les sols non améliorés ont servi de contrôle. Pour évaluer l’impact des pathogènes sur l’ensemble de la communauté bactérienne autochtone et le risque de propagation des pathogènes, nous avons dénombré les bactéries cultivables (microflore hétérotrophe cultivable, indicateur fécal de bactéries et espèces humaines pathogènes). Une analyse de la structure génétique de la communauté de bactéries a été en outre menée dans une culture indépendante (analyse automatisée de l’espaceur intergénique ribosomal, ARISA). Les résultats montrent un enrichissement des bactéries totalement cultivables et la modification de la structure génétique des communautés de bactéries dans les parcelles amendées. L’absence de pathogènes tels que entérocoques, coliformes fécaux, Staphylococcus aureus et pathogènes humains opportunistes (Pseudomonas aeruginosa) suggèrent que les amendements n’induisent pas ces pathogènes et ne sélectionnent pas les communautés. Les populations surveillées des espèces de Stenotrophomonas maltophilia, un pathogène humain opportuniste fréquent dans les sols, permettent toutefois de constater un enrichissement de ces populations dans les sols amendés. L’étude permet de conclure que l’épandage de déchets urbains sur les terres agricoles peut comporter de nombreux risques sanitaires et environnementaux.

Abstract:
The objective of this study was to evaluate the influence of anthropogenic activities such as the application of urban waste on agricultural land which can promote the emergence and/or spread of pathogens. An assessment was conducted on the influence of spreading raw municipal waste on soil bacterial communities and the abundance of opportunistic human pathogens. Soils that had been amended with waste were sampled at three sites in the suburban area of Ouagadougou (Burkina Faso); unamended soil was used as the control. The impact of pathogens on the total indigenous bacterial community and the risk of spreading the pathogens was assessed by counting culturable bacteria (heterotrophic cultivable microflora, faecal indicator bacteria and pathogenic human species); in addition an analysis of the genetic structure of bacterial community in a culture independent approach (method for automated ribosomal intergenic spacer analysis [ARISA]) was carried out. The results showed a total cultivable bacteria enrichment and modification of the genetic structure of bacterial communities in the amended plots. The lack of detection of pathogens such as enterococci and fecal coliform, Staphylococcus aureus or opportunistic human pathogens (Pseudomonas aeruginosa) suggested that the amendments are not sources of these pathogens and do not select the communities. However, monitoring populations of the species Stenotrophomonas maltophilia, an opportunistic pathogen of humans frequently found in soils, showed the enrichment of these populations in amended plots. This work showed that applying urban waste water on agricultural land may pose health and environmental risks.
Hien, E., Favre-Bonté , S., Nazaret, S. and Masse, D. (2014). IMPACT DE L'ÉPANDAGE DE DÉCHETS URBAINS SUR LES COMMUNAUTÉS DE BACTÉRIES DANS LES SOLS CULTIVÉS DE LA PÉRIPHÉRIE DE OAGADOUGOU, BURKINA FASO. Acta Hortic. 1021, 315-323
DOI: 10.17660/ActaHortic.2014.1021.29
https://doi.org/10.17660/ActaHortic.2014.1021.29
déchets urbains, sol, communautés de bactéries, pathogènes humains opportunistes
municipal waste, soil, bacterial community, opportunistic pathogens of humans
French

Acta Horticulturae